MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 111214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007643	TGT	2	6	40	45	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007643	T	6	6	48	53	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007643	GTC	2	6	93	98	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007643	TCG	2	6	237	242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591341
5	NC_007643	CTT	2	6	326	331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591341
6	NC_007643	CGG	2	6	391	396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591341
7	NC_007643	TGA	2	6	448	453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591341
8	NC_007643	CGCT	2	8	474	481	0 %	25 %	25 %	50 %	83591341
9	NC_007643	GGC	2	6	485	490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591341
10	NC_007643	TCG	2	6	498	503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591341
11	NC_007643	TCG	2	6	523	528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591341
12	NC_007643	GC	3	6	532	537	0 %	0 %	50 %	50 %	83591341
13	NC_007643	CCGCTC	2	12	538	549	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	83591341
14	NC_007643	CGG	3	9	601	609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591341
15	NC_007643	CGGC	2	8	615	622	0 %	0 %	50 %	50 %	83591341
16	NC_007643	CGC	2	6	644	649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591341
17	NC_007643	GC	4	8	648	655	0 %	0 %	50 %	50 %	83591341
18	NC_007643	GGC	2	6	677	682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591341
19	NC_007643	C	6	6	718	723	0 %	0 %	0 %	100 %	83591341
20	NC_007643	GAC	2	6	726	731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591341
21	NC_007643	GCG	2	6	807	812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591341
22	NC_007643	GGC	2	6	867	872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591341
23	NC_007643	ATGC	2	8	897	904	25 %	25 %	25 %	25 %	83591341
24	NC_007643	CGC	2	6	931	936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591341
25	NC_007643	ATCT	2	8	948	955	25 %	50 %	0 %	25 %	83591341
26	NC_007643	TCA	2	6	1069	1074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591341
27	NC_007643	GAA	2	6	1095	1100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591341
28	NC_007643	TTC	2	6	1101	1106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591341
29	NC_007643	CAC	2	6	1241	1246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591341
30	NC_007643	CTG	2	6	1449	1454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591341
31	NC_007643	CGA	2	6	1481	1486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591341
32	NC_007643	AAG	2	6	1494	1499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591341
33	NC_007643	CGC	2	6	1545	1550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591341
34	NC_007643	GGCCC	2	10	1562	1571	0 %	0 %	40 %	60 %	83591341
35	NC_007643	AGC	2	6	1597	1602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591341
36	NC_007643	ACCAC	2	10	1651	1660	40 %	0 %	0 %	60 %	83591341
37	NC_007643	CATG	2	8	1664	1671	25 %	25 %	25 %	25 %	83591341
38	NC_007643	CTG	2	6	1731	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591341
39	NC_007643	CGGT	2	8	1942	1949	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007643	GCCC	2	8	1984	1991	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_007643	CGT	2	6	2048	2053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591342
42	NC_007643	GCG	2	6	2057	2062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591342
43	NC_007643	TCG	2	6	2149	2154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591342
44	NC_007643	ACC	2	6	2169	2174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591342
45	NC_007643	ACG	2	6	2272	2277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591342
46	NC_007643	TGCC	2	8	2322	2329	0 %	25 %	25 %	50 %	83591342
47	NC_007643	GATC	2	8	2408	2415	25 %	25 %	25 %	25 %	83591342
48	NC_007643	CTA	2	6	2450	2455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591342
49	NC_007643	ATCT	2	8	2466	2473	25 %	50 %	0 %	25 %	83591342
50	NC_007643	GC	3	6	2507	2512	0 %	0 %	50 %	50 %	83591342
51	NC_007643	GCC	2	6	2568	2573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591342
52	NC_007643	AGA	2	6	2671	2676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591342
53	NC_007643	CGA	2	6	2690	2695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591342
54	NC_007643	CCGA	2	8	2754	2761	25 %	0 %	25 %	50 %	83591342
55	NC_007643	GCC	2	6	2805	2810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591342
56	NC_007643	GAG	2	6	2919	2924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591342
57	NC_007643	GGC	2	6	2930	2935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591342
58	NC_007643	CTCG	2	8	2948	2955	0 %	25 %	25 %	50 %	83591342
59	NC_007643	G	6	6	3005	3010	0 %	0 %	100 %	0 %	83591342
60	NC_007643	CGC	2	6	3035	3040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591342
61	NC_007643	GAC	2	6	3109	3114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591342
62	NC_007643	GCC	2	6	3115	3120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_007643	CCG	2	6	3126	3131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_007643	GCC	2	6	3142	3147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_007643	CGT	2	6	3166	3171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591343
66	NC_007643	CTGACC	2	12	3182	3193	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	83591343
67	NC_007643	GCT	2	6	3201	3206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591343
68	NC_007643	CTG	2	6	3281	3286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591343
69	NC_007643	GGC	2	6	3328	3333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591343
70	NC_007643	GCC	2	6	3348	3353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591343
71	NC_007643	CGC	2	6	3367	3372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591343
72	NC_007643	CGG	2	6	3375	3380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591343
73	NC_007643	GCCC	2	8	3381	3388	0 %	0 %	25 %	75 %	83591343
74	NC_007643	GCC	2	6	3398	3403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591343
75	NC_007643	CGG	2	6	3417	3422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591343
76	NC_007643	GCG	2	6	3441	3446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591343
77	NC_007643	CGG	2	6	3477	3482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591343
78	NC_007643	GGC	2	6	3526	3531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591343
79	NC_007643	GTT	2	6	3580	3585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83591343
80	NC_007643	CGG	2	6	3589	3594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591343
81	NC_007643	GCGA	2	8	3596	3603	25 %	0 %	50 %	25 %	83591343
82	NC_007643	CCG	2	6	3663	3668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591343
83	NC_007643	GCCCAG	2	12	3674	3685	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	83591343
84	NC_007643	CGCC	2	8	3694	3701	0 %	0 %	25 %	75 %	83591343
85	NC_007643	TGC	2	6	3702	3707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591343
86	NC_007643	CG	3	6	3723	3728	0 %	0 %	50 %	50 %	83591343
87	NC_007643	GCTG	2	8	3729	3736	0 %	25 %	50 %	25 %	83591343
88	NC_007643	TGGCG	2	10	3766	3775	0 %	20 %	60 %	20 %	83591343
89	NC_007643	TCG	2	6	3777	3782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591343
90	NC_007643	GC	3	6	3785	3790	0 %	0 %	50 %	50 %	83591343
91	NC_007643	GCG	2	6	3815	3820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591343
92	NC_007643	GC	3	6	3823	3828	0 %	0 %	50 %	50 %	83591343
93	NC_007643	GATC	2	8	3856	3863	25 %	25 %	25 %	25 %	83591343
94	NC_007643	GGCT	2	8	3881	3888	0 %	25 %	50 %	25 %	83591343
95	NC_007643	GCC	2	6	3890	3895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591343
96	NC_007643	GGCCC	2	10	3896	3905	0 %	0 %	40 %	60 %	83591343
97	NC_007643	GCC	2	6	3908	3913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591343
98	NC_007643	GC	3	6	3925	3930	0 %	0 %	50 %	50 %	83591343
99	NC_007643	GC	3	6	3944	3949	0 %	0 %	50 %	50 %	83591343
100	NC_007643	ACCGC	2	10	3973	3982	20 %	0 %	20 %	60 %	83591343
101	NC_007643	GAT	2	6	3983	3988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591343
102	NC_007643	CCG	2	6	4020	4025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591343
103	NC_007643	AGG	2	6	4092	4097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591343
104	NC_007643	CCGC	2	8	4098	4105	0 %	0 %	25 %	75 %	83591343
105	NC_007643	GCT	2	6	4117	4122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591343
106	NC_007643	CGA	2	6	4129	4134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591343
107	NC_007643	GCGCC	3	15	4154	4168	0 %	0 %	40 %	60 %	83591343
108	NC_007643	ACA	2	6	4342	4347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007643	AGA	2	6	4348	4353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007643	CAG	2	6	4368	4373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591344
111	NC_007643	CGA	2	6	4454	4459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591344
112	NC_007643	CAC	2	6	4473	4478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591344
113	NC_007643	GGT	2	6	4490	4495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591344
114	NC_007643	CGA	2	6	4508	4513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591344
115	NC_007643	GAG	2	6	4617	4622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591344
116	NC_007643	GCC	2	6	4632	4637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591344
117	NC_007643	CGG	2	6	4664	4669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591344
118	NC_007643	CGGG	2	8	4699	4706	0 %	0 %	75 %	25 %	83591344
119	NC_007643	GGT	2	6	4727	4732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591344
120	NC_007643	GGT	2	6	4811	4816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591344
121	NC_007643	GGT	2	6	4829	4834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591344
122	NC_007643	GCG	2	6	4843	4848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591344
123	NC_007643	GCACCG	2	12	4852	4863	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	83591344
124	NC_007643	CAC	2	6	4901	4906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591344
125	NC_007643	GCT	2	6	4970	4975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591344
126	NC_007643	CAC	2	6	5006	5011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591344
127	NC_007643	ACG	2	6	5023	5028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591344
128	NC_007643	CCG	2	6	5085	5090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591344
129	NC_007643	GTGCT	2	10	5166	5175	0 %	40 %	40 %	20 %	83591344
130	NC_007643	CAA	2	6	5180	5185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83591344
131	NC_007643	GGC	2	6	5202	5207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591344
132	NC_007643	CGG	2	6	5228	5233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591344
133	NC_007643	TGA	2	6	5275	5280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591344
134	NC_007643	AAAAGG	2	12	5281	5292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591344
135	NC_007643	CCAG	2	8	5368	5375	25 %	0 %	25 %	50 %	83591344
136	NC_007643	GGT	2	6	5411	5416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591344
137	NC_007643	GTC	2	6	5427	5432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591344
138	NC_007643	GGA	2	6	5453	5458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591344
139	NC_007643	AGG	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591344
140	NC_007643	ATC	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591344
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156	NC_007643	GTC	2	6	5931	5936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591344
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222	NC_007643	C	6	6	8705	8710	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
223	NC_007643	TTTG	2	8	8746	8753	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_007643	GAA	2	6	10770	10775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591350
269	NC_007643	CG	3	6	10796	10801	0 %	0 %	50 %	50 %	83591350
270	NC_007643	TATT	2	8	10813	10820	25 %	75 %	0 %	0 %	83591350
271	NC_007643	GAA	2	6	10914	10919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591350
272	NC_007643	CTG	2	6	10926	10931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591350
273	NC_007643	CGC	2	6	11045	11050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591350
274	NC_007643	GTT	2	6	11076	11081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83591350
275	NC_007643	CCAG	2	8	11120	11127	25 %	0 %	25 %	50 %	83591350
276	NC_007643	C	6	6	11128	11133	0 %	0 %	0 %	100 %	83591350
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283	NC_007643	CGGG	2	8	11405	11412	0 %	0 %	75 %	25 %	83591350
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295	NC_007643	CGG	2	6	11839	11844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591350
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299	NC_007643	CTG	2	6	11961	11966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591350
300	NC_007643	C	8	8	12039	12046	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
301	NC_007643	GAC	2	6	12095	12100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591351
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374	NC_007643	GTC	2	6	14826	14831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591354
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382	NC_007643	GGCCG	2	10	15017	15026	0 %	0 %	60 %	40 %	83591354
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389	NC_007643	CCA	2	6	15331	15336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591354
390	NC_007643	ATC	2	6	15399	15404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591354
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392	NC_007643	CGG	2	6	15427	15432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591354
393	NC_007643	GAA	2	6	15440	15445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591354
394	NC_007643	GGC	2	6	15473	15478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591354
395	NC_007643	GGCCG	2	10	15542	15551	0 %	0 %	60 %	40 %	83591354
396	NC_007643	CAG	2	6	15557	15562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591354
397	NC_007643	GGC	2	6	15569	15574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591354
398	NC_007643	CGG	2	6	15595	15600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591354
399	NC_007643	GCCTCG	3	18	15615	15632	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	83591354
400	NC_007643	GGCG	2	8	15640	15647	0 %	0 %	75 %	25 %	83591354
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